Pozytywne skutki ekonomiczne dopuszczenia alternatywnych metod unieszkodliwiania odpadów nie podlegają wątpliwości. Spowodują one spadek cen i odejście szpitali od przestarzałych technologii, na rzecz tańszych i nowoczesnych sterylizatorów czy autoklawów. Najistotniejszą wydaje się kwestia, że obniżone zostaną koszty funkcjonowania publicznej służby zdrowia. Przekłada się to na powstanie wielu podmiotów gospodarczych, specjalizujących się w unieszkodliwianiu odpadów medycznych, a tym stworzenie warunków uczciwej konkurencji dostawców i wielu nowych miejsc pracy.

Średni koszt dobowego utrzymania pacjenta w Polsce to waha się od 5 do 15 zł. Statystycznie przy łóżku pacjenta powstaje ok. 1 kg odpadów medycznych na dobę. Jeśli odpady te będą unieszkodliwiane w sposób alternatywny, każde łóżko przyniesie średnio 1,50 - 2 zł oszczędności. Przy założeniu, że w Polsce jest około 190 000 łóżek, oszczędność może sięgnąć nawet 400 000 złotych dziennie, a zysk dla finansów służby zdrowia można szacować na poziomie co najmniej 100 mln złotych rocznie.

Tak duże rozbieżności w cenach unieszkodliwiania odpadów metodami alternatywnymi a spalarniami, wynikają z kosztów budowy i eksploatacji urządzeń. Koszt budowy spalarni to 6-7 mln złotych, koszt spalenia odpadów to kwota od 2,50 zł do nawet 6,50 zł za kilogram. Opłata z tytułu oddania na składowisko wysoko toksycznych żużli i popiołów to około 650 zł za tonę. Dla przeciwwagi koszt unieszkodliwienia odpadów w sterylizatorze lub autoklawie to około 1,00 zł/kg, a takie urządzenia są nawet 10-krotnie tańsze.

Okazuje się, że tradycyjne spalanie jest najdroższą z dostępnych opcji unieszkodliwiania odpadów, dodatkowo skrajnie nieprzyjazną dla środowiska. Popularne technologie spalania przyczyniają się
do emisji do atmosfery toksycznych dioksyn i furanów.