Czyli rozumiem, że nastąpiło połączenie spółek z tym, że została zawarta całkiem nowa spółka (nowy podmiot), na którą został przeniesiony majątek spółki przejmowanej?
Jeśłi tak, to w przypadku gdy przejmowana spółka dysponowała pozwoleniami, decyzjami itd., spółka przejmująca wchodzi we wszelkie prawa z nich wynikające. Nawet nie trzeba zmieniać tych decyzji w części dot. stony dla któej zostały wydane. Trzeba jednak w takim przypadku kontrolującym udostępnić dokumenty potwierdzające prawo do tych pozwoleń, czyli umowę ;-)
W takim przypadku zalecam przy okazji najbliższych zmian w posiadanych decyzjach zrobić to poprzez wydanie nowych decyzji a nie dokonywanie zmian - żeby nie było zamieszania w papierach. Bardziej dla urzędników niż dla firmy zresztą, żeby się nie pogubili - nie bardzo chce im się to weryfikować - mówię to z praktyki, gdzie próbowali wymuszać określone zachowania zakładów. Nie bez znaczenia są pieniądze chociażby na opłaty skarbowe - zmiany mniej kosztują niż nowe pozwolenia.